Antibiotikler bakterilerle savaşma da kullandığımız ilk ve tek seçenektir. Ancak bu kadar önemli etkilerinin yanısıra yanlış yada uzun süreli kullanımların vücuda zararları bir o kadar çoktur. Aşırı antibiotik tüketimi karaciğer ve böbreklere zarar veriri. Bazı türleri dişlerde renk değişikliğine yol açmaktadır. Mantar oluşmasına neden olur ve bağırsak florasını bozar.Astım,allerji gibi durumların ortaya çıkmasına neden olmaktadır.