Çağatay hanlığı 1227 -1369 yılları arasında hüküm sürmüştür. Türkistan’da kurulmuştur. Fakat bu bölgede yerli Türk yöneticilerin idaresi devam etmiştir. Islamiyeti benimsemeleriyle birlikte Türk-lslam Devleti özelliği kazanan Çağatay Devleti’nin toprakları Timur tarafından ele geçirilmiştir.