Mikrop genel bir terim olarak kullanılır. Bakteriler, virüsler, mantarlar ve bir çok tek hücreliler mikrop olarak adlandırılır.Bakteri ise mikroorganizmalar içinde yer alan tek bir sınıftır. Mikroplar bakterilerde kapsar. Bir çok bakteri kaynaklı hastalıklar antibiyotiklerle tedavi edilirken, mikropların neden olduğu hastalıklarda genellikle işe yaramaz.
Virüs ise canlı hücreleri enfekte edebilen mikroskobik taneciktir.