Bakterilerin bir kısmı zararlı iken bir kısmı da yararlı bakterilerdir. İnsan vücudunda bulunan bakteriler bağışıklık sisteminin oluşması için gereklidir. Bağırsaklarda enerji kaynağı olacak maddeler üretirler. Ayrıca bakteriler K ve B vitamin sentezinde görev yapar. Ayrıca bitkiler için bakteriler önemlidir. Turşu,yoğurt,ayran ve sirkenin mayalanma sürecinde bakterilerden faydalanılır.