Penisilin ,1928 yılında Aleksander Fleming tarafından bulunmuştur. Penisilin rastlantı sonucu bulunmuştur.
Fleming, lam üzerinde zararlı bir bakteri türü olan stafilokokları inceliyordu. Lamın üzerine uçarak konan küf mantarı olan Penicilim notatum yeşil küfün bulunduğu bölümdeki bakterileri öldürdüğünü görmüştür.
Daha sonra gerçekkleştirilen testlerde, bu küfün diğer bakteriler üzerinde de etkili olduğu ortaya çıktı.
1939 yılında, Oxford'dan Howard Florey ve Ernst Chain bu maddeyi ayrıştırmayı başardılar ve buna penicilin adını verdiler.